南醫大二附院眼科擁有強有力的醫療隊伍，主任醫師4人，副主任醫師4人，其中3名博士和碩士。中心擁有當今國際最先進的美國威視S4-IR準分子激光治療儀、美國眼力健波前相差儀、法國依士路全自動電腦磨邊機，日本多美角膜地形圖儀、日本拓普康全自動電腦驗光儀、日本拓普康非接觸眼壓機、日本拓普康進口綜合驗光臺、德國目樂進口手術顯微鏡、美國愛爾康超聲乳化儀、YAG激光儀、德國淚道內窺鏡、蔡司全自動視野計、瑞士900裂隙燈、眼科A/B超、眼底熒光造影、美國博士倫顯微手術系統（超乳波切）、532眼底激光等一批頂級醫療設備。目前開展的項目包括：準分子激光手術治療各種屈光不正(近視、遠視、散光)以及對超高度近視進行有晶體眼人工晶體植入術、激光治療白內障的后發障、超聲乳化手術治療白內障、斜弱視的訓練和手術治療、眼部整形、青光眼、各種淚道疾病的診治等診療項目，以及各種醫學驗光配鏡服務。